Java Desktop System assure non seulement l'interopérabilité entre les applications sur le bureau mais également au niveau de l'entreprise. Parmi ces fonctionnalités, on compte les suivantes :
Les utilisateurs peuvent accéder aux données, aux fichiers et aux imprimantes à la fois dans des environnements Windows et UNIX.
Le système peut se connecter aux systèmes d'arrière-plan existants, notamment aux serveurs Sun Java System Calendaring et Messaging, et aux serveurs de courrier Active Directory, POP3, LDAP et SMTP.
Pour plus d'informations sur le bureau, reportez-vous au Java Desktop System Release 3 User Guide. Pour plus d'informations sur les applications incluses dans Java Desktop System, ouvrez l'aide fournie sur le bureau et sélectionnez l'application spécifique dans le volet de navigation.