Con Java Enterprise System se incluye la versión 3.9.5 de las bibliotecas de seguridad de Netscape. Directory Server, Directory Proxy y Administration Server pueden depender de la versión antigua (3.3.x) de estas bibliotecas, que también están instaladas en /usr/lib/mps/, mientras que los demás productos componentes que dependen de dichas bibliotecas dependen a su vez de la versión más reciente (3.9.5) instalada en /usr/lib/mps/secv1/.