Java Desktop System include le seguenti caratteristiche e funzionalità:
L'ambiente desktop GNOME, la suite di produttività StarOffice, il browser Mozilla, il client di posta e calendario Evolution e Java 2 Platform Standard Edition.
Gli strumenti di amministrazione installati sul server permettono di gestire in modo centralizzato la configurazione, l'installazione e l'amministrazione dell'ambiente desktop degli utenti.
Una serie di strumenti di sviluppo avanzati assiste gli sviluppatori nella creazione di applicazioni per il desktop basate sulla tecnologia Java.
Rispetto alla versione precedente di Java Desktop System, sono state aggiunte le seguenti funzionalità:
Connettore per Microsoft Exchange Server V2.0.1.
Anteprima del calendario Sun Java.