전형적인 FastCGI 응용 프로그램의 코드 구조는 다음과 같습니다.
Initialization code Start of response loop body of response loop End of response loop
초기화 코드는 응용 프로그램을 초기화할 때 한 번만 실행됩니다. 초기화 코드는 보통 데이터베이스 열기 또는 테이블이나 비트맵의 값 계산과 같이 시간이 오래 걸리는 작업을 수행합니다. CGI 프로그램을 FastCGI 프로그램으로 변환할 때의 주된 작업은 초기화 코드를 각 요청에 대해 실행해야 할 코드와 분리하는 것입니다.
응답 루프는 계속 실행되며 클라이언트 요청이 도착하기를 기다립니다. 루프는 FastCGI 라이브러리에 있는 루틴인 FCGI_Accept에 대한 호출로 시작됩니다. FCGI_Accept 루틴은 클라이언트에서 FastCGI 응용 프로그램을 요청할 때까지 프로그램 실행을 차단합니다. 클라이언트 요청이 들어오면 FCGI_Accept 차단이 해제되고 응답 루프 본문이 한 번 실행된 후 다시 차단되어 다른 클라이언트 요청을 기다립니다. 루프는 시스템 관리자 또는 Web Server가 FastCGI 응용 프로그램을 종료한 경우에만 종료됩니다.