Fortran 编译器可从命令行接受多个源文件。单个源文件（也称为编译单元）可以包含任意数量的过程（主程序、子例程、函数、块数据、模块等）。可以将应用程序配置为每个文件一个源代码过程，或者将协同工作的过程集中到单个文件中。《Fortran 编程指南》介绍了这些配置的优缺点。
