Para facilitar un rápido desarrollo e implementación de aplicaciones, Sun GlassFish Enterprise Server v3 es compatible con diversos lenguajes de secuencia de comandos. El uso de lenguajes de línea de comandos permite aplicar Enterprise Server más allá de los desarrollos centrados en tecnología Java. Entre los lenguajes de secuencia de comandos compatibles se encuentran:
JRuby y Rails: un lenguaje de secuencia de comandos y una estructura para desarrollar aplicaciones web
Grails: Una estructura de aplicaciones web que saca el máximo partido del lenguaje de programación Groovy y complementa el desarrollo web Java
Jython y Django: una implementación de Java del lenguaje Python y una estructura web para Python y las implementaciones de Python (como, por ejemplo, Jython)
jMaki: Una estructura para crear aplicaciones web Ajax
La compatibilidad con estos lenguajes de secuencia de comandos es posible gracias a componentes que se encuentran disponibles a través de la Herramienta de actualización.