Sun GlassFish Enterprise Server v3 incluye los siguientes cambios de diseño de archivo respecto a las versiones anteriores:
El directorio de instalación predeterminado es el siguiente:
Sistemas Solaris, Linux y Mac OS X: directorio-de inicio-del usuario /glassfishv3
Sistemas Windows: Unidaddelsistema :\glassfishv3
Se ha agregado un subdirectorio glassfish con otros subdirectorios debajo.
Las bibliotecas de productos se han trasladado de Glassfish/lib a glassfish/modules.
Se ha agregado un directorio osgi.
Se ha agregado un directorio diseñado para archivos legales. Ahora los archivos de licencia y copyright se encuentran en glassfish/legal.
Sun GlassFish Message Queue se instala en un directorio de nivel superior en lugar de hacerlo en un subdirectorio.
Java DB se instala en un directorio de nivel superior en lugar de hacerlo en un subdirectorio.