Les applications de bureau sont intégrées dans Java Desktop System qui offre une réelle interopérabilité entre les applications. Les fonctions d'interopérabilité comprennent notamment :
des fonctions de glisser-déposer ou de copier-coller de texte, de graphiques ou d'autres éléments entre les applications ;
une sélection d'imprimantes universelles parmi les imprimantes disponibles du réseau, ce qui permet d'inclure des imprimantes des réseaux Windows ;
un point d'entrée unique pour la gestion des répertoires et des fichiers, ainsi que pour les ordinateurs en réseau ;
un accès direct au contenu des données et des fichiers en lançant une application d'un simple clic pour visualiser les fichiers contenus dans les e-mails, les pages Web et le gestionnaire de fichiers.