apt は、注釈処理用の新しいコマンド行ユーティリティです。これには、プログラムの注釈を処理するためのリフレクト API セットとサポート用インフラも含まれます。
http://java.sun.com/j2se/1.5.0/ja/docs/ja/guide/apt/index.html にあるドキュメントを参照してください。