この現象は、ユーザー定義文字を登録している領域に空き領域 (未登録領域) がある場合に発生します。この場合、空き領域が空き領域に続くユーザー定義文字で埋められてしまいます。
回避方法: Windows の外字ツールで、空き領域の最後に空白を登録してください。