Sun Java Enterprise System 5 Update 1 リリースノート

Web Server インストールディレクトリに以前にインストールしたバージョンのファイルが格納されている場合、Web Server のインストールは失敗する (バグ番号なし)

解決方法: すべての設定ファイルをバックアップします。その後、インストールディレクトリを削除してから、Java Enterprise System インストーラを使用して Web Server をインストールします。