Use el comando cp -r para copiar directorios y los archivos que contengan:
$ cp -r veggies veggies3 $ |
Este comando copia todos los archivos y directorios dentro del directorio veggies en un nuevo directorio veggies3. Esta es una copia recursiva, como designa la opción -r. Si intenta copiar un directorio sin usar esta opción, aparecerá un mensaje de error.