Avec Java Desktop System Configuration Manager 1.1, le stockage des profils n'est possible qu'au niveau racine de la hiérarchie des organisations et des domaines dans le serveur LDAP. Desktop Manager permet, en revanche, de conserver les profils à différents emplacements de la structure hiérarchique. Cette fonction d'administration déléguée est très pratique notamment lorsque plusieurs administrateurs sont chargés de la configuration de différentes branches de la hiérarchie des organisations et des domaines, sans que cela n'ait d'interférence.
Lors de la migration vers Desktop Manager, les profils Configuration Manager 1.1 figurant sur le serveur LDAP restent à la racine de la hiérarchie des organisations et des domaines. Vous pouvez, si besoin est, changer l'emplacement de ces profils sur le serveur LDAP à l'aide de l'assistant Copier et déplacer ou à partir des options avancées des profils. Cependant, lorsque vous déplacez un profil existant vers un nouvel endroit, le profil n'est plus compatible avec Java Desktop System Configuration Manager 1.1. Autrement dit, si vous avez choisi de migrer complètement vos agents Configuration Manager 1.1 vers Desktop Manager, utilisez exclusivement la fonction d'administration déléguée.