JMS を REMOTE モードの Enterprise Server として設定している場合、MQ ブローカが起動していないと起動に失敗します。
次のように JVM オプションを設定します。com.sun.enterprise.jms.CONNECT_MQ_LAZILY=true 。この JVM オプションを設定したあとは、MQ ブローカが起動していない場合でも Enterprise Server を起動できます。ただし、サーバーを起動する前に、MQ を起動することをお勧めします。