自動インボイスが選択した明細より少ない明細を処理したのはなぜですか。

これは、請求書のクレジット・メモと請求書自体がどちらも同じ発行の一部だった場合に起こります。

クレジット・メモが最初に選択された場合、請求書がまだ処理されていないため、クレジット・メモは失敗にはならずに未処理になります。未処理のクレジット・メモがインタフェース表に残り、「自動インボイスのインポート」プロセスを次回発行する際に処理されます。