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Conda環境の作成と公開

Conda環境を管理するためのすべての管理タスクは、ADMINユーザーのみが実行できます。

次の例では、新しいConda環境を作成し、外部Pythonパッケージをインストールし、環境を内部ストレージに保持するステップを説明します。 これらのタスクはADMINユーザーのみが実行できることに注意してください。

1. 「ノートブック」ページに移動し、新しいノートブックを開きます。
2. Conda段落に新しいConda環境を作成します。

   ヒント:

   ノートブック段落の下部にカーソルを置き、「Conda段落の追加」アイコンをクリックして、ノートブックでConda段落を即時に開くことができます。

   次に、新しいConda環境を作成するための2つの選択肢について説明します。 該当するオプションを選択できます:

   • 「PyPGX APIおよびその他の外部Pythonパッケージ」を操作するには、次のコマンドを実行します:

     %conda
     copy-local-env -n graphenv

     次の例では、basegraph環境をコピーして、Conda環境graphenvを作成します:

     
     図conda_copy_env.pngの説明
   • 「外部Pythonパッケージのみ」を使用するには、次のコマンドを実行してConda環境を作成します:

     %conda
     create -n graphenv python==3.6.8

     次の例では、指定されたPythonバージョンでConda環境graphenvを作成します:

     
     「図conda_create_env.pngの説明」
3. 新しく作成したgraphenvにサード・パーティのPythonパッケージをインストールします。 たとえば、次のコマンドはgraphenvにpandas 1.3.5パッケージをインストールします。

   %conda
   install -n graphenv pandas=1.3.5

   
   「図cond_install_pkg.pngの説明」

   ADMINユーザーとして、basegraph環境で提供されているバージョン以外の別のPythonバージョンをインストールすることもできます。 そのためには、まず前のステップで作成したConda環境をアクティブ化する必要があります。 その後、デフォルトのPythonライブラリをアンインストールし、次に示すように必要なPythonバージョンをインストールできます:

   activate <env_name>
   uninstall python
   install python=3.9

4. 次のようにConda環境をアップロードします:

   %conda
   upload graphenv --overwrite --description 'Conda environment with Pandas'

   
   「図conda_upload_env.pngの説明」
5. オプションで、次のようにアップロードされたすべての環境をリストして確認します:

   %conda
   list-saved-envs

   
   「図conda_list_saved_env.pngの説明」