Можно временно отключить (а затем включить) расписание агента.
Если расписание агента отключено, агент не запускается в установленное время. Однако агент можно запустить другими способами, например с помощью кнопки Выполнить агент сейчас в редакторе агентов.
Также можно отключить и включить расписание агента с помощью флажка Включено на вкладке "График" в редакторе агентов.