ウィンドウを閉じると、すべてのワークスペースからウィンドウが削除されます。
それまでに行なった処理を保存してから、アプリケーション・ウィンドウを閉じてください。
[Alt]+[Tab] キーを押して、閉じたいウィンドウに強調表示を移動します。
[Alt]+[F4] キーを押します。