Java Desktop System propose les fonctionnalités suivantes :
Ces composants comprennent l'environnement de bureau GNOME, la suite de productivité StarOffice, le navigateur Mozilla, le client Messagerie et calendrier d'Evolution et Java 2 Platform Standard Edition.
Des outils d'administration côté serveur permettent de centraliser les opérations de configuration, de déploiement et de gestion de l'environnement de bureau utilisateur.
Grâce à des outils performants, les développeurs peuvent facilement concevoir des applications Java pour le bureau.
De nouvelles fonctionnalités d'applications ont été ajoutées depuis la dernière version de Java Desktop System :
Connecteur pour Microsoft Exchange Server version 2.0.1.
Affichage du calendrier Sun Java.