在 shell 提示符下调用的编译器有一个简单的命令，其语法是：
f95 [options] files...
其中，files… 是一个或多个以 .f、.F、.f90、.f95、.F90、.F95 或 .for 结尾的 Fortran 源文件名称；options 是一个或多个编译器选项标志。（以 .f90 或 .f95 扩展名结尾的文件是只能由 f95 编译器识别的“自由格式”Fortran 95 源文件。）
在下面的示例中，我们在启用运行时调试的情况下，使用 f95 来编译两个源文件以生成名为 growth 的可执行文件：
demo% f95 -g -o growth growth.f fft.f95
新增功能：该编译器还接受扩展名为 .f03 或 .F03 的源文件。这些文件将被视为与 .f95 和 .F95 等效，并且可以作为一种方式来表示源文件包含 Fortran 2003 扩展名。
命令行文件命名约定说明了编译器可以识别的各种源文件扩展名。