分割交易可讓您只配對局部交易，先忽略分割後剩餘的未配對金額，從而管理 1 對多、多對 1 或多對多配對的時間性差異。這協助您在每天結束時讓未配對的交易數盡可能維持在低數量，允許複查者查看含較少未配對交易的調節。管理員必須啟用此功能，使用者才能分割交易。
交易配對 1 對多、多對 1 及多對多時，這會讓調節變得很困難，因為需要更多交易才能讓配對集平衡。1 對多、多對 1 及多對多配對的時機差異性很難處理，因為會有許多未配對的交易持續等候可平衡配對集的剩餘交易完成載入。
以下是標準來源 (總帳) 對子系統 (銀行)，這是 1 個總帳對 5 間銀行 (1 對多) 配對的範例：
在第 2 天，使用者注意到銀行總金額為 $9,990.00，但應該是 $10,000.00，這表示銀行端有 $10.00 的錯誤。銀行需要至少 2 週才能修正金額 $10.00 的問題，因此使用者在銀行修正前會有 6 個持續等待中的未配對交易。對於未配對的存款金額 $10,000.00 來說這是很長的處理時間，因此使用者可以將「$10,000.00 總帳」分割成兩個交易。分割之後，使用者可以配對 $9,990.00 總帳與 $9,990.00 銀行總金額，先不配對 $10.00 總帳，直到第 15 天銀行最終傳送 $10.00 銀行為止。此分割可讓使用者維持簡單明瞭的調節，尤其是當有大量此類配對時。
配對將會：
在銀行修正 $10.00 的問題後，執行「自動配對」或「手動配對」將配對交易。
啟用分割交易
若要在未配對交易畫面中啟用分割，管理員必須在「資料來源」頁籤中啟用允許分割交易。若要啟用「分割」選項，請執行下列動作：
從應用程式按一下配對類型，並選取想要的配對類型 (例如，結算)。
在「資料來源」畫面中，按一下允許分割交易核取方塊。
按一下儲存。
分割交易圖示隨即會顯示在未配對交易畫面。
註：