ユーザーマネージャでユーザー初期設定ファイルをカスタマイズして作成することはできませんが、指定された「スケルトン」ディレクトリ内のユーザー初期設定ファイルでユーザーのホームディレクトリを生成することができます。
/etc/skel ディレクトリにあるユーザー初期設定テンプレートをカスタマイズし、それらをユーザーのホームディレクトリへコピーできます。