Anwendungen können Malware und böswilligen Benutzern als Einstiegspunkte dienen. In Oracle Solaris wird diesen Bedrohungen durch die Verwendung von Benutzerrechten und die Eingrenzung von Anwendungen in Zonen begegnet. Anwendungen können mit den Berechtigungen ausgeführt werden, die allein für die jeweilige Anwendung erforderlich sind, sodass ein böswilliger Benutzer keine Root-Berechtigung zum Zugriff auf das restliche System erhält. Das Ausmaß eines Angriffs kann über Zonen eingegrenzt werden. Angriffe auf Anwendungen in einer nicht globalen Zone können sich nur auf Prozesse in der jeweiligen Zone auswirken, nicht jedoch auf Prozesse im Hostsystem der Zone.
Die Funktionen ASLR (Address Space Layout Randomization) und SMF (Service Management Facility) bieten darüber hinaus weiteren Schutz für Anwendungen. ASLR macht es Angreifern schwer, die Kontrolle über eine ausführbare Datei zu übernehmen, während Administratoren über SMF-Funktionen das Starten und Stoppen sowie die Verwendung einer Anwendung einschränken können.