根據預設，檔案管理員不會顯示資料夾中特定的系統與備份檔案。此做法可避免意外修改或刪除這些檔案而導致電腦作業受損，也可讓 [Home] (個人) 資料夾等位置不致於太雜亂。檔案管理員不會顯示：
檔案名稱開頭為句點 (.) 的隱藏檔案
檔案名稱結尾為波浪符號 (~) 的備份檔案
特定資料夾的 .hidden 檔案中列出的檔案
若要隱藏或顯示特定資料夾中的隱藏檔案，請選取 [View (檢視) -> Show Hidden Files (顯示隱藏檔案)]。若要設定檔案管理員永遠顯示隱藏檔案，請將 [View] (檢視) 偏好設定設為 [Show Hidden and Backup Files] (顯示隱藏或備份的檔案)。如需詳細資訊，請參閱Setting File Manager Preferences。
若要在檔案管理員中隱藏檔案或資料夾，請重新命名檔案，讓其名稱以句點 (.) 字元為開頭，或在相同資料夾中建立名為 .hidden 的文字檔案，然後將要隱藏檔案的名稱加入此文字檔中。
若要重新整理相關的檔案管理員視窗以查看變更，請按 Ctrl+R。