MiniCluster richiede l'uso de protocollo di rete SSH per garantire che l'utente possa eseguire il login, in tutta sicurezza, ai nodi di calcolo (zone globali) e alle istanze delle virtual machine (zone non globali) MiniCluster.
Quando un utente esegue il login per la prima volta utilizzando il protocollo SSH, il sistema genera in modo automatico una nuova coppia di chiavi SSH.