Las VLAN se ignoran en el STP que cumple con los estándares. El protocolo de puentes calcula sólo una topología sin bucles mediante mensajes de BPDU sin etiquetas y utiliza esta topología de árbol para activar y desactivar enlaces. Debe configurar los enlaces duplicados que se proporcionan en sus redes, de manera que cuando esos enlaces son desactivados de forma automática por el STP, las VLAN configuradas no se desconectan. Debe ejecutar todas las VLAN en toda la red principal con puentes o examinar con cuidado todos los enlaces redundantes.
El protocolo TRILL no sigue las reglas STP complejas. En cambio, TRILL encapsula automáticamente los paquetes que tienen la etiqueta de VLAN intacta y los transfiere por la red.