Java のプロファイリングでは、JavaVirtual Machine Tools Interface (JVMTI) が使用され、実行のひずみと実行時間の拡大が発生する場合があります。
クロックプロファイリングとハードウェアカウンタプロファイリングの場合、データ収集プロセスは JVM ソフトウェアへのさまざまな呼び出しを行い、プロファイリングイベントをシグナルハンドラ内で処理します。これらのルーチンのオーバーヘッドとディスクへの実験の書き込みコストにより、Java プログラムの実行時間の拡大が生じます。そのような実行時間の拡大は通常 10% より少なくなります。